Среди программ Евроазиатского еврейского конгресса, направленных на развитие межнационального и межконфессионального диалогов, традиционно много внимания уделяется международному межнациональному детскому летнему лагерю «Истоки толерантности». Концепция лагеря уникальна. В нем принимают участие подростки из различных национальных общин, которые в течение смены не только знакомятся с национальными традициями своих сверстников, но и сами проживают каждый день в разных национальных традициях. 6–26 августа 2008 г. в Одессе (Украина) прошла первая смена лагеря. В лагере побывали 150 детей, представляющих 13 национальных общин Украины (армянскую, крымско-татарскую, польскую, еврейскую, литовскую, русскую, греческую, венгерскую, молдавскую и т.д.). Воспитателями работали 33 педагога из 12 национальных общин Украины, Беларуси, Молдовы. Директор лагеря – Сергей Хараху, координатор львовского «Клуба толерантности», работающего при поддержке ЕАЕК и Конгресса национальных общин Украины. 13 августа в рамках лагеря была проведена акция «Защитим детей Южной Осетии, Грузии и России». Ее целью было привлечь внимание политиков и общественности к страданиям детей-беженцев, продемонстрировать поддержку и сострадание всем жертвам войны. Во время акции дети писали письма-рисунки президентам Грузии Михаилу Саакашвили и России Дмитрию Медведеву. Письма были официально переданы в консульства России и Грузии в Одессе.

13-29 августа 2008 г. в пгт Ясиня (Закарпатская область, Украина) прошла вторая смена лагеря. В Закарпатье побывали 155 детей из 11 национальных общин: украинской, русской, еврейской, крымско-татарской, польской, немецкой, татарской, болгарской, венгерской, армянской, молдавской, румынской из Украины, Беларуси, Молдовы. 28 представителей национальных общин составляли педагогический коллектив лагеря. Директор лагеря – Наталья Бакулина.